Arrate Muñoz Barrutia

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Coautores

Carlos Ortiz de SolorzanoFull Professor - CIMA - Universidad de NavarraDirección de correo verificada de unav.es
Michael UnserProfessor, Biomedical Imaging Group, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), SwitzerlandDirección de correo verificada de epfl.ch
Estibaliz Gómez-de-MariscalPostdoc Henriques Lab, Gulbenkian Institute for Molecular Medicine, Oeiras, PortugalDirección de correo verificada de gimm.pt
Ignacio Arganda-CarrerasIkerbasque Associate Researcher at University of the Basque Country, Biofisika Institute and DIPCDirección de correo verificada de ehu.eus
JUAN JOSE VAQUEROProfessor, Universidad Carlos III de MadridDirección de correo verificada de ing.uc3m.es
Denis WirtzT.H. Smoot Professor of Engineering Science, Pathology, and Oncology; VP Research, Johns HopkinsDirección de correo verificada de jhu.edu
Daniel SageBiomedical Imaging Group, Center for Imaging, EPFL, Lausanne, SwitzerlandDirección de correo verificada de epfl.ch
Mario CeresaJoint Research Center, European CommissionDirección de correo verificada de ec.europa.eu
Wei OuyangAssistant Professor, Science for Life Laboratory | KTH Royal Institute of Technology, StockholmDirección de correo verificada de kth.se
DANIEL GARCIA GONZALEZUniversidad Carlos III de MadridDirección de correo verificada de ing.uc3m.es
Pedro M. GordalizaCenter for Biomedical Imaging (CIBM), Universidad Carlos III de MadridDirección de correo verificada de unil.ch
Carlos García-López-de-HaroDirección de correo verificada de alumnos.uc3m.es
Thomas PengoDirector of Research Informatics, U of MinnesotaDirección de correo verificada de umn.edu
Clara Gomez-CruzPhD student, Universidad Carlos III de MadridDirección de correo verificada de pa.uc3m.es
Carlos Oscar S. Sorzano (ORCID:000...National Center of Biotechnology (CSIC)Dirección de correo verificada de cnb.csic.es
Javier J ZuluetaProfessor of Medicine, Chief, Pulmonary, Critical Care and Sleep Medicine, Mount Sinai MorningsideDirección de correo verificada de mountsinai.org
Daniel Franco-BarrancoPostdoc Cardona's lab at MRC LMB - Cambridge University and DIPCDirección de correo verificada de mrc-lmb.cam.ac.uk
Jan KybicFaculty of Electrical Engineering, Czech Technical University in PragueDirección de correo verificada de fel.cvut.cz
Maria J. Ledesma-CarbayoFull Professor, Universidad Politécnica de MadridDirección de correo verificada de upm.es
Pablo Delgado-RodriguezPostdoc, Danmarks Tekniske Universitet (DTU)Dirección de correo verificada de dtu.dk

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Arrate Muñoz Barrutia

Professor, Univ. Carlos III de Madrid; Instituto de Investigación Sanitaria Gregorio Marañón

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image processing biomedical imaging microscopy radiology


Título Ordenar por citas Ordenar por año Ordenar por título	Citado por Citado por	Año
3D reconstruction of histological sections: Application to mammary gland tissue I Arganda‐Carreras, R Fernández‐González, A Muñoz‐Barrutia, ... Microscopy Research and Technique 73 (11), 1019-1029, 2010	713	2010
Combination strategies in multi-atlas image segmentation: Application to brain MR data X Artaechevarria, A Muñoz-Barrutia, C Ortiz-de-Solorzano Medical Imaging, IEEE Transactions on 28 (8), 1266-1277, 2009	659	2009
An objective comparison of cell-tracking algorithms V Ulman, M Maška, KEG Magnusson, O Ronneberger, C Haubold, ... Nature methods 14 (12), 1141-1152, 2017	620	2017
A benchmark for comparison of cell tracking algorithms M Maška, V Ulman, D Svoboda, P Matula, P Matula, C Ederra, A Urbiola, ... Bioinformatics 30 (11), 1609-1617, 2014	509	2014
Adiposoft: automated software for the analysis of white adipose tissue cellularity in histological sections M Galarraga, J Campión, A Muñoz-Barrutia, N Boqué, H Moreno, ... Journal of Lipid Research 53 (12), 2791-2796, 2012	442	2012
DeepImageJ: A user-friendly environment to run deep learning models in ImageJ E Gomez-de-Mariscal, C Garcia-Lopez-de-Haro, W Ouyang, L Donati, ... Nature Methods 18, 1192-1195, 2021	222	2021
Characterization of three-dimensional cancer cell migration in mixed collagen-Matrigel scaffolds using microfluidics and image analysis M Anguiano, C Castilla, M Maška, C Ederra, R Peláez, X Morales, ... PloS one 12 (2), e0171417, 2017	182	2017
Comparing algorithms for automated vessel segmentation in computed tomography scans of the lung: the VESSEL12 study RD Rudyanto, S Kerkstra, EM van Rikxoort, C Fetita, PY Brillet, C Lefevre, ... Medical image analysis 18 (7), 1217-1232, 2014	181	2014
Automated neuromelanin imaging as a diagnostic biomarker for Parkinson's disease G Castellanos, MA Fernández‐Seara, O Lorenzo‐Betancor, ... Movement Disorders 30 (7), 945-952, 2015	180	2015
Least-squares image resizing using finite differences A Muñoz-Barrutia, T Blu, M Unser IEEE Trans. Image Process 10 (9), 1365-1378, 2001	164	2001
ANHIR: automatic non-rigid histological image registration challenge J Borovec, J Kybic, I Arganda-Carreras, DV Sorokin, G Bueno, ... IEEE transactions on medical imaging 39 (10), 3042-3052, 2020	148	2020
Segmentation and Shape Tracking of Whole Fluorescent Cells Based on the Chan-Vese Model M Maska, O Danek, S Garasa, A Rouzaut, A Muñoz-Barrutia, OS Carlos IEEE Transactions on Medical Imaging 32 (6), 995-1006, 2013	144	2013
The Cell Tracking Challenge: 10 years of objective benchmarking M Maška, V Ulman, P Delgado-Rodriguez, E Gómez-de-Mariscal, ... Nature Methods, 2023	127	2023
Continuous wavelet transform with arbitrary scales and O (N) complexity A Muñoz, R Ertlé, M Unser Signal processing 82 (5), 749-757, 2002	116	2002
Use of the p-values as a size-dependent function to address practical differences when analyzing large datasets E Gomez-de-Mariscal, V Guerrero, A Sneider, H Jayatilaka, JM Phillip, ... Scientific Reports 11 (20942), 2021	91	2021
Applications of Light Sheet Microscopy in Microdevices I Albert-Smet, A Marcos-Vidal, JJ Vaquero, M Desco, A Muñoz-Barrutia, ... Frontiers in Neuroanatomy 13, 1, 2019	85	2019
Bioimage model zoo: a community-driven resource for accessible deep learning in bioimage analysis W Ouyang, F Beuttenmueller, E Gómez-de-Mariscal, C Pape, T Burke, ... bioRxiv, 2022.06. 07.495102, 2022	72	2022
New Strategies for Echocardiographic Evaluation of Left Ventricular Function in a Mouse Model of Long-Term Myocardial Infarction C Benavides-Vallve, D Corbacho, O Iglesias-Garcia, B Pelacho, E Albiasu, ... PloS one 7 (7), e41691, 2012	72	2012
Quantification of lung damage in an elastase-induced mouse model of emphysema A Muñoz-Barrutia, M Ceresa, X Artaechevarria, LM Montuenga, ... Journal of Biomedical Imaging 2012, 5, 2012	69	2012
Benchmarking of Image Registration Methods for Differently Stained Histological Slides J Borovec, A Munoz-Barrutia, J Kybic 2018 25th IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), 3368-3372, 2018	64	2018

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